福建省港航建設發展有限公司（以下簡稱公司）于2014年12月根據省委省政府關于省級行政機關與所辦（屬）企業和經營性資產脫鉤的改革部署重組成立。以原省交通運輸廳所屬的福建省港航建設開發公司為主體，將福建省公路局所屬福建公路開發總公司并入，劃入福建省港航局持有的招商局漳州開發區股權，注冊資本31830萬元。
2017年6月，公司與福建省交通運輸集團有限責任公司整合重組，現股權結構為：福建省交通運輸集團有限責任公司持有79.62%股權，福建省國有資產管理有限公司持有20%股權，福建省港航勘察設計院持有0.38%股權。公司現擁有控股子公司6家、參股子公司6家。
省委省政府、省交通集團賦予公司“省級港口岸線資源收儲開發投融資平臺”“交通集團內部建設管理平臺”的“雙平臺”定位。公司主要經營范圍為港口及航運設施工程建筑；工程管理服務；對建筑業的投資。2017年6月，公司與福建省交通運輸集團有限責任公司整合重組，現股權結構為：福建省交通運輸集團有限責任公司持有79.62%股權，福建省國有資產管理有限公司持有20%股權，福建省港航勘察設計院持有0.38%股權。公司現擁有控股子公司6家、參股子公司6家。
自成立以來，公司積極融入國家“一帶一路”戰略和福建自貿區建設，先后與省內沿海主要地市國有港口企業、500強民營企業簽訂戰略投資協議，參與投資建設福州、莆田多個重點核心港區碼頭及后方陸域，同時承擔國家重點工程--閩江航運工程開發建設任務，此外積極拓展項目代建、管理等輔助業務，逐步發展成為主業突出、多元發展的現代化港口建設企業。
未來，公司將秉承“誠信 創新 和諧 感恩”的企業精神，立足福建、面向世界，廣納良才、砥礪奮進，全面發揮省內港口建設“雙平臺”和主力軍作用，為創造“機制活 產業優 百姓富 生態美”的新福建貢獻力量。